Razlika između verzija stranice "Helikaza"

[pregledana izmjena][pregledana izmjena]
Uklonjeni sadržaj Dodani sadržaj
Red 11:
Helikaze imaju različite strukture i statuse [[oligomer]]acije. Dok se [[dnkB helikaza | dnkB]]-olike helikaze opružaju u [[heksamer]]e [[DNK]] u obliku kifle, drugi enzimi su aktivni kao [[monomer]]i ili proteinski dimeri. Istraživanja su pokazala da helikaze mogu djelovati pasivno, čekajući nektalitsko opuštanje, a onda se premješta između razdvojenih niti ili mogu imati aktivnu ulogu kao katalizatori u odvajanju lanca, koristeći energiju proizvedenu hidrolizom [[ATP]] . U drugom slučaju, helicakaza djeluje na relativno aktivan motor, odmotavanjem i premještanjem duž njegovog supstrata kao direktan rezultat aktivnosti [[ATPaza|ATPaze]]. <ref>http: //www.physorg.com/news102663442.html - Istraživači riješiti misteriju kako se razdvaja DNK.</ref> Helicaze mogu mnogo brže djelovati ''[[in vivo]] '' nego ''[[in vitro]]'', zbog prisustva proteina te pomoći u destabilizaciji viljuškaste veze.
 
===Aktiviranje barijera u djelovanju helikaze===
Helikazna enzimska akcija, kao što je odmotavanje nukleinskih kiselina , se postiže se smanjenjem aktivacije barijerebarijera ('''''B''''') svake konkretnespecifične akcijereakcije. AktivacijaAktivacijska barijera je posljedica djelovanje različitih faktora, a može se definiratiodrediti pomoćuprimjenom sljedećeslijedeće jednadžbe,<br> gdjeu kojoj je:
*'''n''N''''' = broj neodmotanihneopruženih [[bazni par|baznih parova]] (bps), <br>
*'''ΔG<sub>bp</sub>''' = slobodna energija stvaranjaformiranja bazogbaznog para,<br>
*'''G<sub>int</sub>''' = smanjenjeredukcija slobodne energije zbogpod uticajem helikaze, i <br>
*'''G<sub>ƒ</sub>''' = smanjenjeredukcija slobodne energije zbogpod nepovezaneuticajem snage:nezipiranih snaga:
 
:'''''B''''' = '''''N''''' '''(ΔG<sub>bp</sub>-G<sub>int</sub>-G<sub>ƒ</sub>)'''
 
Faktori koji doprinose visini aktivacije barijere uključuju:.
Line 25 ⟶ 29:
Veličina barijere aktivacije koja se prevazilazi doprinosom helikaze, je kriterij klasifikacije na kao aktivne ili pasivne helikaze U pasivnih helikaza, postoji značajna barijera aktivacije (definiran kao '''B'''k<sub>B</sub>T, gdje je k<sub>B</sub> je [[Bolcmanova konstanta]] i '''T''' je temperatura sistema). Zbog ove značajne barijera aktivacije, progresija opružanja u velikoj mjeri zavisi od sekvenca nukleinskih kiselina unutar uključenih [[molekula]], kao i prisustvo sila destabilizacije koje djeluju na replikacijsku viljušku. Određene kombinacije nukleinske kiseline će smanjiti stope odmotavanja ([[guanin]] i [[citozin]]), dok razne destabilizirajuće sile mogu povećati stopu odmotavanja. U pasivnim sistemima, stopa opružanja (V<sub>UN</sub>) je manja od stope translokacije (V<sub>trans</sub>) – premještanje duž jednolančane nukleinske kiseline (ssNA ). Još jedan način da se prikažu pasivne helikaze je da se one oslanjaju na prolazne raspade baznih parova na replikacijskoj viljuški, kako bi se utvrdila njena stopu opuštanja.
 
U aktivnim helikazama, '''B'''<sub>B</sub>T, gdje je sistem u kojem nema značajnih barijera, kao što je helikaza u mogućnosti da se destabilizira nukleinskih kiselina, neodmotani dvostrukog heliksa konstantnom brzinom, bez obzira na sekvence nukleinskih kiselina. U aktivnom helicases, V<sub>UN</sub> je približno jednak V<sub>trans</sub>. Još jedan način da gledaju aktivne helicase je njegova sposobnost da izravno destabilizira replikacije viljuške za promociju odmotavanje.
 
==Također pogledajte==