Razlika između verzija stranice "Helikaza"

[pregledana izmjena][pregledana izmjena]
Uklonjeni sadržaj Dodani sadržaj
No edit summary
Red 9:
Helikaze uvezuju metaboličke procesi RNK, kao što su [[translacija]], [[transkripcija]], [[biogeneza ribosoma]], [[prerada RNK]], njeno editiranje i degradacija. Helicaze se pomjeraju postepeno uz jednu nit dupleksa [[nukleinske kiseline]] sa usmjerivošću i processivnošću koje su specifične za svaki pojedinačni enzim.
 
Helikaze imaju različite strukture i statuse [[oligomer]]acije. Dok se [[dnkB helikaza | dnkB]]-olike helikaze opružaju u [[heksamer]]e [[DNK]] u obliku kifle, drugi enzimi su aktivni kao [[monomer]]i ili proteinski dimeri. Istraživanja su pokazala da helikaze mogu djelovati pasivno, čekajući nektalitsko opuštanje, a onda se premješta između razdvojenih niti ili mogu imati aktivnu ulogu kao katalizatori u odvajanju lanca, koristeći energiju proizvedenu hidrolizom [[ATP]] . U drugom slučaju, helicakaza djeluje na relativno aktivan motor, odmotavanjem i premještanjem duž njegovog supstrata kao direktan rezultat aktivnosti [[ATPaza|ATPaze]]. <ref>http: //www.physorg.com/news102663442.html - Istraživači riješiti misteriju kako se razdvaja DNK.</ ref> Helicaze mogu mnogo brže djelovati ''[[in vivo]] '' nego ''[[in vitro]]'', zbog prisustva proteina te pomoći u destabilizaciji viljuškaste veze.
 
==Aktiviranje barijera u djelovanju helikaze==
Helikazna enzimska akcija, kao što je odmotavanje nukleinskih kiselina , se postiže se smanjenjem aktivacije barijere ('''B''') svake konkretne akcije. Aktivacija barijera je posljedica djelovanje različitih faktora, a može se definirati pomoću sljedeće jednadžbe,<br> gdje: '''n''' = broj neodmotanih baznih parova (bps), <br>'''ΔG<sub>bp</sub>''' = slobodna energija stvaranja bazog para,<br>'''G<sub>int</sub>''' = smanjenje slobodne energije zbog helikaze, i <br>'''G<sub>ƒ</ sub>''' = smanjenje slobodne energije zbog nepovezane snage:
 
: = '''''N''''' '''(ΔG<sub>bp</sub>-G<sub>int</sub>-G<sub>ƒ</sub>)'''
Red 21:
*napetost koja je prisutna u replikacijskoj viljuški, i
*snaga destabilizacije.
 
=== Aktivna i pasivna helikaza ===
Veličina barijere aktivacije koja se prevazilazi doprinosom helikaze, je kriterij klasifikacije na kao aktivne ili pasivne helikaze U pasivnih helikaza, postoji značajna barijera aktivacije (definiran kao '''B'''k<sub>B</sub>T, gdje je k<sub>B</sub> je [[Bolcmanova konstanta]] i '''T''' je temperatura sistema). Zbog ove značajne barijera aktivacije, progresija opružanja u velikoj mjeri zavisi od sekvenca nukleinskih kiselina unutar uključenih [[molekula]], kao i prisustvo sila destabilizacije koje djeluju na replikacijsku viljušku. Određene kombinacije nukleinske kiseline će smanjiti stope odmotavanja ([[guanin]] i [[citozin]]), dok razne destabilizirajuće sile mogu povećati stopu odmotavanja. U pasivnim sistemima, stopa opružanja (V<sub>UN</sub>) je manja od stope translokacije (V<sub>trans</sub>) – premještanje duž jednolančane nukleinske kiseline (ssNA ). Još jedan način da se prikažu pasivne helikaze je da se one oslanjaju na prolazne raspade baznih parova na replikacijskoj viljuški, kako bi se utvrdila njena stopu opuštanja.