Razlika između verzija stranice "Helikaza"

[pregledana izmjena][pregledana izmjena]
Uklonjeni sadržaj Dodani sadržaj
No edit summary
No edit summary
Red 3:
[[Genom]] čovjeka kodira 95 neredundantnih helikaza: 64 RNK i 31 DNK helikazu. Mnogi ćelijski procesi, kao što su [[replikacija DNK]], [[transkripcija| transkripcije]], [[translacija|translacije]], [[genetička rekombinacija | rekombinacije]], [[popravak DNK]] i [[biogeneza ribosoma]], uključuju odvajanje niti nukleinskih kiselina, što zahtijeva korištenje helikaza.
 
==Funkcija==
[[File:DNA_replication.svg|200px|thumbnail|right|Helicase action in DNA replication]]
Helikaze se često upotrebljavaju za razdvajanja polulanaca dvojnog hrliksa [[DNK]] ili samoobnavljajućih [[RNK]] molekula pomoću energije iz [[hidroliza|hidrolize]] [[adenozintrifosfata | ATP]]. Proces odlikuje razbijanje [[vodikova veza|vodikovih veza]] obveznica između [[bazn par | nukleotida]] dušične baze. Aktivne su i uuklanjanjeu protein koji su vezani za [[nukleinske kiseline]] i katalizi homologne rekombinacije DNK
Helikaze uvezuju metaboličke procesi RNK, kao što su [[translacija]], [[transkripcija]], [[biogeneza ribosoma]], [[prerada RNK]], njeno editiranje i degradacija. Helicaze se pomjeraju postepeno uz jednu nit dupleksa [[nukleinske kiseline]] sa usmjerivošću i processivnošću koje su specifične za svaki pojedinačni enzim.
 
Helikaze imaju različite strukture i statuse [[Oligomer|oligomeracije]]. Dok se [[dnkB helikaza | dnkB]]-olika helikaze opuštaju [[heksamer]]e [[DNK]] u obliku kifle, drugi enzimi su aktivni kao [[monomer]]i ili proteinski dimeri. Istraživanja su pokazala da helikaze mogu djelovati pasivno, čekajući nektalitsko opuštanje, a onda se premješta između razdvojenih niti ili mogu imati aktivnu ulogu kao katalizatori u odvajanju lanca, koristeći energiju proizvedenu hidrolizom [[ATP]] . U drugom slučaju, helicakaza djeluje na relativno aktivan motor, odmotavanjem i premještanjem duž njegovog supstrata kao direktan rezultat aktivnosti [[ATPaza|ATPaze]]. <ref>http: //www.physorg.com/news102663442.html - Istraživači riješiti misteriju kako se razdvaja DNK.</ ref> Helicaze mogu mnogo brže djelovati ''[[in vivo]] '' nego ''[[in vitro]]'', zbog prisustva proteina te pomoći u destabilizaciji viljuškaste veze.
===Aktiviranje barijera u djelovanju helikaze==
Helikazna enzimska akcija, kao što je odmotavanje nukleinskih kiselina , se postiže se smanjenjem aktivacije barijere ('' '' 'B' '' '') svake konkretne akcije. Aktivacija barijera je posljedica djelovanje različitih faktora, a može se definirati pomoću sljedeće jednadžbe, gdje '' '' 'n' '' '' = broj neodmotanih baznih parova (bps), '' 'ΔG <sub> bp </ sub>' '' = slobodna energija stvaranja bazog para, '' 'G <sub> int </ sub>' '' = smanjenje slobodne energije zbog helikaze, i '' 'G <sub> ƒ </ sub>' '' = smanjenje slobodne energije zbog unzipping snage.
 
: = '''''N''''' '''(ΔG<sub>bp</sub>-G<sub>int</sub>-G<sub>ƒ</sub>)'''
Faktori koji doprinose visini aktivacije barijere uključuju:.
*pecifičnost sekvence uključene molekule nukleinske kiseline,
*broj uključenih baznih parova uključeni,
*napetost koja je prisutna u replikacijskoj viljuški, i
*snaga destabilizacije.
=== Aktivna i pasivna helikaza ===
Veličina barijere aktivacije koja se prevazilazi doprinosom helikaze, je kriterij klasifikacije na kao aktivne ili pasivne helikaze U pasivnih helikaza, postoji značajna barijera aktivacije (definiran kao '' '' 'B' '' ''> k <sub> B </ sub> T, gdje je k <sub> B </ sub> je [[Bolcmanova konstanta ]] i T je temperatura sistema). Zbog ove značajne barijera aktivacije, progresija opružanja u velikoj mjeri zavisi od sekvenca nukleinskih kiselina unutar uključenih [[molekula]], kao i prisustvo sila destabilizacije koje djeluju na replikacijsku viljušku. Određene kombinacije nukleinske kiseline će smanjiti stope odmotavanja ([[guanin]] i [[citozin]]), dok razne destabilizirajuće sile mogu povećati stopu odmotavanja. U pasivnim sistemima, stopa opružanja (V<sub>UN</sub>) je manja od stope translokacije (V<sub>trans</sub>) – premještanje duž jednolančane nukleinske kiseline (ssNA ). Još jedan način da se prikažu pasivne helikaze je da se one oslanjaju na prolazne raspade baznih parova na replikacijskoj viljuški, kako bi se utvrdila njena stopu opuštanja.
 
U aktivnim helikazama, '''B'''<sub>B</sub>T, gdje je sistem u kojem nema značajnih barijera, kao što je helikaza u mogućnosti da se destabilizira nukleinskih kiselina, neodmotani dvostrukog heliksa konstantnom brzinom, bez obzira na sekvence nukleinskih kiselina. U aktivnom helicases, V<sub>UN</sub> je približno jednak V<sub>trans</sub>. Još jedan način da gledaju aktivne helicase je njegova sposobnost da izravno destabilizira replikacije viljuške za promociju odmotavanje.
 
 
==Također pogledajte==
*[[DNK]]