Razlika između verzija stranice "Proteaza"
[pregledana izmjena] | [pregledana izmjena] |
Uklonjeni sadržaj Dodani sadržaj
N-Proteaza |
|||
Red 6:
===Katalitski ostatak===
Proteaze se mogu naučno svrstati u sedam skupina:
* [[Serin proteaza]] - pomoću [[serin]] [[alkohol]]a
* [[Cistein proteaza]] - koristeći [[cistein]] [[tiol]]
* [[Aspartat proteaza]] - pomoću
* [[Treonin proteaza]] s - koristeći [[treonin]] [[alkohol|sekundarni alkohol]]
* [[Glutaminska kiselina proteaza]] - koristeći [glutamat]] [[
* [[Metalo-]] - pomoću [[metal]]a, obično [[cink]]a
* [[Asparagin peptid lijaza]] -
Proteaze su prvobitno grupiran u 84 porodica, u skladu sa svojim evolucijskim odnosima, a u [[1993]]. su svrstane u četiri katalitska tipa:
Red 19:
*[[aspartam]]ske, i
*[[metalo proteaze]].
U [[treonin]] i [[glutaminske kiseline | glutaminska kiselina]] proteaza nisu opisane sve do 1995. godine, odnosno 2004. godine. Mehanizam se koristi za prionuti na [[peptidne veze]] uključuje pravljenje ostatak aminokiselina koja ima [[cistein]] i treonin (proteaza) ili molekula vode ([[aspartamska kiselina]], metallo- i proteaza glutaminska kiselina) nukleofilne tako da može napasti peptida [[karboksilna]] grupa. Jedan od načina da se nukleofil je od strane [[katalitičke trijade]], gdje se koristi [[histidin]] ostatak za aktiviranje [[serin]], [[cistein]], ili [[treonin]] kao nukleofil. Ovo nije evolucijska grupacije, međutim, kao nukleofil vrste imaju [[katalitičke trijade | evoluirao convergently]] u različitim [[proteina natporodice | superfamilije]], a neki superfamilije pokazuju različite evoluciju na više različitih nukleofila.<ref>http://jb.oxfordjournals.org/content/151/1/13.long, New families of carboxyl peptidases: serine-carboxyl peptidases and glutamic peptidases.</ref>▼
▲
A sedmi katalitičke tip proteolitičkih enzima, asparagina peptid liaza, opisan je u 2011. To je, međutim neobičan enzim koji se ne ponaša kao ostali proteaza; to ne koristi hidrolize postići lomljenja obveznica, umjesto na asparagin formira ciklički hemijske strukture koja sama po sebi prionuti na asparagina ostataka u proteinima pod pravim uvjetima. To je proteolitičkih enzima, ali spada u drugu klasu enzima, a njegovo uključivanje kao peptidaze može biti sporna.<ref>http://www.jbc.org/content/286/44/38321.full?sid=04913b93-98b7-434f-ae4a-e135a36e4061, Asparagine peptide lyases: a seventh catalytic type of proteolytic enzymes.</ref>▼
▲
=== Evolucijske veze ===
Podaci o evolucijskoj klasifikaciji proteaza za [[proteinska natporodica| proteinske natporodice]] nalaze se u MEROPS bazi podataka. U njoj su prvo svrstane po 'klanovima' (natporodicama) zasnovanim na strukturi, mehanizmu djelovanja i redu katalitskog ostatka (npr. u [[PA klan]]u, gdje P ukazuje na mješavinu nukleofilne porodice). Unutar svakog 'klana', proteaza se svrstavaju u porodice na osnovu sekvence sličnosti (npr S1 i C3 obitelji u PA klan). Svaka porodica može sadržavati više stotina srodnih proteaza (npr. [[
Trenutno su poznati više od 50 klanova, a svaki ukazuje nezavisno evolucijsko porijeklo proteolize.
==Također pogledajte==
*[[Enzim]]
|