U4/U6.U5 tri-snRNP-pridruženi protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SART1.[5][6]

SART1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4PYU

Identifikatori
AliasiSART1
Vanjski ID-jeviOMIM: 605941 MGI: 1309453 HomoloGene: 133770 GeneCards: SART1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za SART1
Genomska lokacija za SART1
Bend11q13.1Početak65,961,728 bp[1]
Kraj65,980,137 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 19 (miš)
Hrom.Hromosom 19 (miš)[2]
Hromosom 19 (miš)
Genomska lokacija za SART1
Genomska lokacija za SART1
Bend19|19 APočetak5,427,551 bp[2]
Kraj5,438,731 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta citoplazma
citosol
Cajal body
Golđijev aparat
U4/U6 x U5 tri-snRNP complex
catalytic step 2 spliceosome
spliceosomal complex
jedro
nukleoplazma
nuclear speck
U2-type precatalytic spliceosome
Biološki proces mRNA cis splicing, via spliceosome
positive regulation of cytotoxic T cell differentiation
intrinsic apoptotic signaling pathway
mRNA splicing, via spliceosome
mRNA processing
maturation of 5S rRNA
spliceosomal snRNP assembly
Prerada RNK
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005146

NM_016882

RefSeq (bjelančevina)

NP_005137

NP_058578

Lokacija (UCSC)Chr 11: 65.96 – 65.98 MbChr 19: 5.43 – 5.44 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ovaj gen kodira dva proteina, protein SART1 (800) eksprimiran u u jedru većine ćelija koje se razmnožavaju i protein SART1 (259) u citosolu epitelnog karcinoma. SART1 (259) protein prevodi se mehanizmom-1 pomjeranja okvira tokom posttranskripcijske regulacije. Smatra se da su dva kodirana proteina uključena u regulaciju proliferacije. Oba proteina imaju odbacivanje tumorskih antigena. Protein SART1 (259) ima tumorski epitop koji je sposoban inducirati HLA-A24 02 ograničene citotoksične T-limfocite u pacijenata s rakom. Ovaj SART1 (259) antigen može biti koristan u specifičnoj imunoterapiji za oboljele od raka i može poslužiti kao paradigmatski alat za dijagnostiku i liječenje pacijenata sa atopijom. Utvrđeno je da je protein SART1 (259) bitan za regrutiranje tri-snRNP u presplajsosomu na putunjegovog sklapanja.[6]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 800 aminokiselina, а molekulska težina 90.255 Da.[7]

1020304050
MGSSKKHRGEKEAAGTTAAAGTGGATEQPPRHREHKKHKHRSGGSGGSGG
ERRKRSRERGGERGSGRRGAEAEARSSTHGRERSQAEPSERRVKREKRDD
GYEAAASSKTSSGDASSLSIEETNKLRAKLGLKPLEVNAIKKEAGTKEEP
VTADVINPMALRQREELREKLAAAKEKRLLNQKLGKIKTLGEDDPWLDDT
AAWIERSRQLQKEKDLAEKRAKLLEEMDQEFGVSTLVEEEFGQRRQDLYS
ARDLQGLTVEHAIDSFREGETMILTLKDKGVLQEEEDVLVNVNLVDKERA
EKNVELRKKKPDYLPYAEDESVDDLAQQKPRSILSKYDEELEGERPHSFR
LEQGGTADGLRERELEEIRAKLRLQAQSLSTVGPRLASEYLTPEEMVTFK
KTKRRVKKIRKKEKEVVVRADDLLPLGDQTQDGDFGSRLRGRGRRRVSEV
EEEKEPVPQPLPSDDTRVENMDISDEEEGGAPPPGSPQVLEEDEAELELQ
KQLEKGRRLRQLQQLQQLRDSGEKVVEIVKKLESRQRGWEEDEDPERKGA
IVFNATSEFCRTLGEIPTYGLAGNREEQEELMDFERDEERSANGGSESDG
EENIGWSTVNLDEEKQQQDFSASSTTILDEEPIVNRGLAAALLLCQNKGL
LETTVQKVARVKAPNKSLPSAVYCIEDKMAIDDKYSRREEYRGFTQDFKE
KDGYKPDVKIEYVDETGRKLTPKEAFRQLSHRFHGKGSGKMKTERRMKKL
DEEALLKKMSSSDTPLGTVALLQEKQKAQKTPYIVLSGSGKSMNANTITK

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000175467 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039148 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Shichijo S, Nakao M, Imai Y, Takasu H, Kawamoto M, Niiya F, Yang D, Toh Y, Yamana H, Itoh K (Mar 1998). "A gene encoding antigenic peptides of human squamous cell carcinoma recognized by cytotoxic T lymphocytes". J Exp Med. 187 (3): 277–88. doi:10.1084/jem.187.3.277. PMC 2212124. PMID 9449708.
  6. ^ a b "Entrez Gene: SART1 squamous cell carcinoma antigen recognized by T cells".
  7. ^ "UniProt, O43290". Pristupljeno 27. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi