Transmembranski protein inducibilan hormonom rasta (GHITM), poznat i kao transmembranski motiv inhibitora BAX koji sadrži protein 5 (TMBIM5), je protein koji je kod ljudi kodiran genom GHITM na hromosomu 10.[5][6][7] Član je motiva BAX inhibitor koji sadrži (TMBIM) porodicu i lokaliziran na unutrašnjoj mitohondrijskoj membrani (IMM), kao i endoplazmatskom retikulumu (ER), gdje ima ulogu u apoptozama, posredstvom mitohondrija i morfologije i oslobađanja citohroma C.[8][9] Putem apoptozne funkcije, GHITM može biti uključen u tumorske metastaze i urođene antivirusne reakcije.[10][11]

GHITM
Identifikatori
AliasiGHITM
Vanjski ID-jeviMGI: 1913342 HomoloGene: 8667 GeneCards: GHITM
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 10 (čovjek)
Hrom.Hromosom 10 (čovjek)[1]
Hromosom 10 (čovjek)
Genomska lokacija za GHITM
Genomska lokacija za GHITM
Bend10q23.1Početak84,139,482 bp[1]
Kraj84,154,841 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 14 (miš)
Hrom.Hromosom 14 (miš)[2]
Hromosom 14 (miš)
Genomska lokacija za GHITM
Genomska lokacija za GHITM
Bend14 B|14 21.29 cMPočetak36,842,049 bp[2]
Kraj36,857,229 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
molekularna funkcija
Ćelijska komponenta Egzosom
membrana
integral component of membrane
mitochondrial inner membrane
mitohondrija
Biološki proces GO:0097285 apoptoza
GO:0022610 biološki proces
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_014394

NM_001199122
NM_078478
NM_001359902

RefSeq (bjelančevina)

NP_055209

NP_001186051
NP_510963
NP_001346831

Lokacija (UCSC)Chr 10: 84.14 – 84.15 MbChr 14: 36.84 – 36.86 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 345 aminokiselina, а molekulska težina 37.205 Da.[12]

1020304050
MLAARLVCLRTLPSRVFHPAFTKASPVVKNSITKNQWLLTPSREYATKTR
IGIRRGRTGQELKEAALEPSMEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCYYG
LGLSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSAIAISRTPV
LMNFMMRGSWVTIGVTFAAMVGAGMLVRSIPYDQSPGPKHLAWLLHSGVM
GAVVAPLTILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGV
GLGLVFVSSLGSMFLPPTTVAGATLYSVAMYGGLVLFSMFLLYDTQKVIK
RAEVSPMYGVQKYDPINSMLSIYMDTLNIFMRVATMLATGGNRKK

Struktura uredi

Ovaj gen kodira protein od 37 kDa koji navodno sadrži šest do osam transmembranskih domena. Kao član porodice TMBIM, GHITM dijeli transmembranski BAX inhibicijski motiv, poluhidrofobni transmembranski domen i sličnu tercijarnu strukturu s ostalih pet članova. Međutim, za razliku od drugih članova, GHITM ima jedinstveni kiseli (D) umjesto bazni) (H ili R) u blizini svog drugog transmembranskog domena, kao i dodatni transmembranski domen, koji nakon cijepanje iza ostatka 57 (SREY| A) signalizira lokalizaciju na IMM.[8][9][10] Bez obzira na to, moguće je da je rascjep na različitim mjestima (motiv sličan XXRR (LAAR) u N-terminalu i motiv sličan KKXX (GNRK) u C-terminalu) ili alternativna prerada mogu objasniti uočenu lokalizaciju proteina u ER.[9][10]

Funkcija uredi

GHITM je mitohondrijski protein i član je porodice TMBIM i potporodice inhibitora BAX-1 (BI1).[8][9] Sveprisutno je eksprimiran, ali ga posebno ima u velikom broju u tkivu organa kao što su mozak, srce, jetra, bubreg i skeletni mišići i rijetki u crijevima i timusu.[9] Ovaj protein se posebno lokalizira u IMM-u, gdje regulira apoptozu, putem dva odvojena procesa:

  • (1) BAX-neovisno upravljanje mitohondrijskom morfologijom i
  • (2) oslobađanje citohroma C.
    U prvom procesu, GHITM održava organizaciju krista, a njegova podregulacija dovodi do mitohondrijske fragmentacije, vjerovatno induciranjem spajanja struktura krista, što dovodi do oslobađanja proapoptoznih proteina, kao što je citokrom c, Smac i Htra2. U drugom procesu, GHITM je odgovoran za umrežavanje citohroma c s IMM-om, a povećana regulacija GHITM-a povezana je s odgođenim oslobađanjem citohroma c, bez obzira na vanjsku mitohondrijsku membranu permeabilizaciju. Dakle, GHITM kontrolira oslobađanje citohroma C iz mitohondrija i potencijalno može ometati apoptotski proces radi podsticanja preživljavanja ćelija.[8][9] Štaviše, GHITM može dalje imati ulogu u apoptozi, održavanjem homeostaze kalcijskog iona u ER. Međutim, dok prekomjerna ekspresija drugih proteina TMBIM -a pokazuje antiapoptozne učinke, smanjujući koncentracije iona kalcija, čime se sprječava preopterećenje mitohondrijskim ionima kalcija, depolarizacija, gubitak ATP, reaktivne vrste kisika , oslobađanje citohroma c, i na kraju, ćelijska smrt, prekomjerna ekspresija GHITM-a proizvodi suprotan učinak.[9]

Klinički značaj uredi

GHITM može biti uključen u metastaze tumora interakcijom s proteinima porodice Bcl-2 za regulaciju apoptoze.[10][11] Njegova uloga apoptotskog regulatora također ga može povezati s urođenim antivirusnim odgovorima.[11] Također je primijećeno da prekomjerna ekspresija GHITM -a ubrza proces starenja u HIV-inficiranih pacijenata.[13]

Interakcije uredi

Pokazano je da GHITM ima interakcije sa citohromom C.[8]

Reference uredi

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165678 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041028 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (Apr 1996). "A "double adaptor" method for improved shotgun library construction". Analytical Biochemistry. 236 (1): 107–13. doi:10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
  6. ^ Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (Apr 1997). "Large-scale concatenation cDNA sequencing". Genome Research. 7 (4): 353–8. doi:10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
  7. ^ "Entrez Gene: GHITM growth hormone inducible transmembrane protein".
  8. ^ a b c d e Oka T, Sayano T, Tamai S, Yokota S, Kato H, Fujii G, Mihara K (Jun 2008). "Identification of a novel protein MICS1 that is involved in maintenance of mitochondrial morphology and apoptotic release of cytochrome c". Molecular Biology of the Cell. 19 (6): 2597–608. doi:10.1091/mbc.E07-12-1205. PMC 2397309. PMID 18417609.
  9. ^ a b c d e f g Lisak DA, Schacht T, Enders V, Habicht J, Kiviluoto S, Schneider J, Henke N, Bultynck G, Methner A (Sep 2015). "The transmembrane Bax inhibitor motif (TMBIM) containing protein family: Tissue expression, intracellular localization and effects on the ER CA(2+)-filling state". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research. 1853 (9): 2104–14. doi:10.1016/j.bbamcr.2015.03.002. PMID 25764978.
  10. ^ a b c d Zhou J, Zhu T, Hu C, Li H, Chen G, Xu G, Wang S, Zhou J, Ma D (Jun 2008). "Comparative genomics and function analysis on BI1 family". Computational Biology and Chemistry. 32 (3): 159–62. doi:10.1016/j.compbiolchem.2008.01.002. PMID 18440869.
  11. ^ a b c Li S, Wang L, Berman M, Kong YY, Dorf ME (Sep 2011). "Mapping a dynamic innate immunity protein interaction network regulating type I interferon production". Immunity. 35 (3): 426–40. doi:10.1016/j.immuni.2011.06.014. PMC 3253658. PMID 21903422.
  12. ^ "UniProt, Q9H3K2". Pristupljeno 2. 9. 2021.
  13. ^ Moni MA, Liò P (24. 10. 2014). "Network-based analysis of comorbidities risk during an infection: SARS and HIV case studies". BMC Bioinformatics. 15: 333. doi:10.1186/1471-2105-15-333. PMC 4363349. PMID 25344230.

Dopunska literatura uredi