GATD3A

(Preusmjereno sa C21orf33)

Mitohondrijski glutamin-amidopeptizoliki protein 3A klase 1 sa domenom jest protein koji je kod ljudi kodiran genom GATD3A sa hromosoma 21.[5][6]

GATD3A
Identifikatori
AliasiGATD3
Vanjski ID-jeviOMIM: 601659 MGI: 1351861 HomoloGene: 3416 GeneCards: GATD3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 21 (čovjek)
Hrom.Hromosom 21 (čovjek)[1]
Hromosom 21 (čovjek)
Genomska lokacija za GATD3A
Genomska lokacija za GATD3A
Bend21q22.3Početak44,133,610 bp[1]
Kraj44,210,114 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za GATD3A
Genomska lokacija za GATD3A
Bend10 C1|10 39.72 cMPočetak77,997,900 bp[2]
Kraj78,005,616 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_004649
NM_198155
NM_001320383
NM_001320384

NM_138601
NM_001364646

RefSeq (bjelančevina)
NP_001307312
NP_001307313
NP_004640
NP_937798
NP_001350687

NP_001350689
NP_001350690

NP_613067
NP_001351575

Lokacija (UCSC)Chr 21: 44.13 – 44.21 MbChr 10: 78 – 78.01 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Iako peptidima koji ciljaju mitohondrije nedostaje zajednička konsenzusna sekvenca, nedavno je pronađena određena pristranost u pozicijskoj distribuciji aminokiselina. Ovi obrasci povezani su sa cijepanjem proteinskog prekursora proteazama za obradu matriksa. Pronađni su novi motivi sekvenci koji su konzevirani unutar podgrupa mitohondrijalnih ciljanih peptida. Ovi motivi imaju određene zajedničke teme, što ukazuje da su povezani s cijepanjem jedne proteaze. Dva od konzerviranih obrazaca imaju visoku prediktivnu vrijednost, ali čak i za sekvence koje nemaju ove obrasce, pokazalo se da je moguće prilično precizno predviđanje mjesta cijepanja. Također predlaženo je da se dobro konzervirani obrazac smanjenja RXY (S/A) može koristiti za projektovanje efikasno prepoznatih mjesta cijepanja u necijepljene ili umjetne mitohondrijske ciljane peptide.[7]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 268 aminokiselina, a molekulska težina 28.170 Da.[7]

1020304050
MAAVRVLVASRLAAASAFTSLSPGGRTPSQRAALHLSVPRPAARVALVLS
GCGVYDGTEIHEASAILVHLSRGGAEVQIFAPDVPQMHVIDHTKGQPSEG
ESRNVLTESARIARGKITDLANLSAANHDAAIFPGGFGAAKNLSTFAVDG
KDCKVNKEVERVLKEFHQAGKPIGLCCIAPVLAAKVLRGVEVTVGHEQEE
GGKWPYAGTAEAIKALGAKHCVKEVVEAHVDQKNKVVTTPAFMCETALHY
IHDGIGAMVRKVLELTGK

Također pogledajte

uredi

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160221 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000053329 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Scott HS, Chen H, Rossier C, Lalioti MD, Antonarakis SE (Jun 1997). "Isolation of a human gene (HES1) with homology to an Escherichia coli and a zebrafish protein that maps to chromosome 21q22.3". Hum Genet. 99 (5): 616–23. doi:10.1007/s004390050416. PMID 9150728. S2CID 22793851.
  6. ^ Lafreniere RG, Rochefort DL, Kibar Z, Fon EA, Han F, Cochius J, Kang X, Baird S, Korneluk RG, Andermann E, Rommens JM, Rouleau GA (Mar 1997). "Isolation and characterization of GT335, a novel human gene conserved in Escherichia coli and mapping to 21q22.3". Genomics. 38 (3): 264–72. doi:10.1006/geno.1996.0627. PMID 8975701.
  7. ^ a b "GATD3A glutamine amidotransferase like class 1 domain containing 3A [ Homo sapiens (human) ]".

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi